모비율 검정 예제

Wald 시험은 β의 ML 추정의 점액성 정상성에 근거를 둔다. Wald를 사용하는 대신 대부분의 통계학자들은 LR 테스트를 선호합니다. 이전의 신념과 지식에 따라 각인 효과(모성 또는 친자)만 존재하고 MAF가 낮음(<0.2)인 경우 POO, PAT 및 TAT 방법은 모두 각인 효과를 감지하는 합리적인 힘을 보여줍니다(도 2c 및 3c). 다른 방법들(LRT, PO-LRT, CPG, CEPG 및 EMIM)을 포함하는 경우, 상이한 효과를 분리하기에 부족한 데이터가 있기 때문에 각인 효과를 검출하는 데 덜 잘 수행된다. 우리는 직관적 인 TDT와 같은 접근 방식 (예 : PLINK의 POO 테스트)은 독립의 가정이 항상 충족되지 않기 때문에 피해야합니다 (부모 모두이종및 협회가 감지된 가족의 전송은 독립적이지 않습니다). PAT는 그림 2c 및 3c및 표 3, 행 2, PAT 및 TAT 열에서 볼 수 있듯이 낮은 MAF의 TAT에 비해 전력이 약간 증가한 것을 보여줍니다. 따라서 각인 효과만 존재하고 낮거나 높은 MAF에서 만 있는지 확인하면 PAT를 권장합니다. R1, R2, S1, S2는 각각 자식 또는 어머니가 수행한 복사본과 비교하여 변형 대중전자의 C=1, C=2, M=1, M=2 사본을 나타내는 모델의 변수입니다. 변수 mt는 메이트 유형 매개 변수를 나타내는 데 사용됩니다.

우도비 테스트에 적합한 중첩 모델은 « LRT »라고 표시된 열에 표시됩니다. Im은 모델에서 각인하기 위한 변수를 나타내는 데 사용됩니다. `Combined_LRT`는 누락된 데이터의 양이 다른 트라이어드, 쿼드 및 퀸트를 포함한 패밀리 유형의 혼합물을 분석하는 데 사용할 수 있습니다. Trans-generational 효력은 표현형의 비 유전 결정 (상속의 관점에서)로 이끌어 내는 기계장치를 포함합니다. 모계 유전적 효과는 모계 유전자형이 어머니에게서 자손에게 전달된 유전 물질에 관계없이 자손의 표현형에 영향을 미칠 때 발생합니다. 이것이 일어날 수 있는 한 가지 방법은 어머니의 유전자형이 자궁 내 환경을 통해 태아의 발달에 영향을 미칠 때입니다. 모계 효과의 예는 Drosophila에서 관찰되었습니다, 돌연변이는 그 때 태아의 발달에 영향을 미칠 수 있는 난모세포에서 작용 [22, 23]. 유래의 부모 효력은 관련되는 유전 물자의 부모 기원이 자손의 표현형에 영향을 미칠 수 있는 유전 기계장치의 수를 포위합니다. 기원의 부모 효과는 많은 복잡한 무질서의 근본적인 유전 기계장치를 해명하는 추가 적인 수단을 제시할 수 있습니다 [72]. GWAS 데이터에서 탐구되는 주요 모-원산지 효과는 게놈 각인 및 모계 유전 적 효과, 어머니 / 자손 유전자 형 상호 작용 효과입니다. GWAS 트리오 연구에서 원산지 모체 효과를 테스트하는 방법론은 간단한 카이 스퀘어 테스트에서 보다 복잡한 모델에 이르기까지 다양하게 제안되었습니다. 적절한 통계 적 방법을 선택하기 전에 사전 지식을 고려하여 관심있는 모국어 효과와 자손 유전자 형 효과를 동시에 찾을지 여부를 고려하는 것이 중요합니다.

표 5는 다양한 원산지 모체 효과를 검출할 수 있는 방법을 지정하여 여기에 제안된 다양한 방법에 대한 요약을 제공합니다. 이제 원산지 모체 효과및 MAF의 유형에 대한 사전 지식 측면에서 권장되는 방법을 자세히 설명할 가치가 있습니다.

Les commentaires sont fermés.